Одноклеточная мультиомика выявляет диссинхронию врожденного и адаптивного иммунитета при прогрессирующем течении COVID-19

Nature Communications (2022):13:440

Single-cell multi-omics reveals dyssynchrony of the innate and adaptive immune system in progressive COVID-19

Avraham Unterman, Tomokazu S. Sumida, Nima Nouri, Xiting Yan, Amy Y. Zhao, Victor Gasque, Jonas C. Schupp, Hiromitsu Asashima, Yunqing Liu, Carlos Cosme Jr., Wenxuan Deng, Ming Chen, Micha Sam Brickman Raredon, Kenneth B. Hoehn, Guilin Wang, Zuoheng Wang, Giuseppe DeIuliis, Neal G. Ravindra, Ningshan L, Christopher Castaldi, Patrick Wong, John Fournier, Santos Bermejo, Lokesh Sharma, Arnau Casanovas-Massana, Chantal B. F. Vogels, Anne L. Wyllie, Nathan D. Grubaugh, Anthony Melillo, Hailong Meng, Yan Stein, Maksym Minasyan, Subhasis Mohanty, William E. Ruff, Inessa Cohen, Khadir Raddassi, The Yale IMPACT Research Team, Laura E. Niklason, Albert I. Ko, Ruth R. Montgomery, Shelli F. Farhadian, Akiko Iwasaki, Albert C. Shaw, David van Dijk, Hongyu Zhao, Steven H. Kleinstein, David A. Hafler, Naftali Kaminski, Charles S. Dela Cruz

Одноклеточная мультиомика выявляет диссинхронию врожденного и адаптивного иммунитета при прогрессирующем течении COVID-19

Аннотация

Нарушение регуляции иммунных реакций против вируса SARS-CoV-2 играет значимую роль в тяжелом течении COVID-19. Однако иммунные сигнатуры, связанные с иммунопатологией, изучены недостаточно. В исследовании был использован мультиомический одноклеточный анализ для изучения динамических иммунных реакций у госпитализированных пациентов со стабильным или осложненным течением COVID-19, изучены репертуары V(D)J (иммунный репертуар включает в себя различные подтипы, которые иммунная система организма создает из иммуноглобулинов или Т-клеточных рецепторов) и была проведена оценка клеточных эффектов тоцилизумаба.

Скоординированное профилирование экспрессии генов и маркеров белков клеточной линии показывает, что классические моноциты S100Ahi/HLA-DRlo и активированные Т-клетки LAG-3hi являются признаками прогрессирующего заболевания и подчеркивают аномальное взаимодействие MHC-II/LAG-3 с миелоидными и Т-клетками соответственно. Были также обнаружены искаженные репертории рецепторов Т-клеток в расширенных эффекторных клонах CD8+, немутированных клонах В-клеток IGHG+ и мутировавших клонах В-клеток со стабильной частотой соматической гипермутации с течением времени.

Выводы: Углубленное иммунное профилирование выявляет диссинхронию врожденного и адаптивного иммунного взаимодействия при прогрессирующем течении COVID-19.

doi.org

Перевод на русский язык научной статьи осуществлен в соответствии с условиями открытой лицензии Creative Commons Attributions (CC BY) ( Creative Commons — Attribution 4.0 International — CC BY 4.0)