Front. Cell. Infect. Microbiol. 11:656674.
Oral Microbiome Characteristics in Patients with Autoimmune Hepatitis
Benchen Rao1, Jiamin Lou, Haifeng Lu, Hongxia Liang, Juan Li, Heqi Zhou, Yajuan Fan, Hua Zhang, Ying Sun, Yawen Zou, Zhongwen Wu, Yan Jiang, Zhigang Ren, Zujiang Yu
Характеристики микробиома полости рта у пациентов с аутоиммунным гепатитом
Аннотация
Аутоиммунный гепатит (АИГ) – распространенная причина цирроза печени. Чтобы определить характеристики микробиома полости рта у пациентов с АИГ, было собрано 204 образца слюны у 68 пациентов с АИГ и у 136 здоровых лиц контрольной группы. Было проведено микробиологическое секвенирование на приборе MiSeq после скрининга. Все образцы были случайным образом разделены на когорты обнаружения (46 с АИГ и 92 здоровых лиц) и когорты валидации (22 с АИГ и 44 здоровых лиц). Кроме того, были взяты образцы у 12 пациентов с АИГ из города Ханчжоу для межрегиональной валидации. Были описаны характеристики микробиома полости рта у пациентов с АИГ и создана диагностическая модель. В группе с АИГ разнообразие микробиома полости рта оказалось значительно шире. Микробные сообщества заметно различались между двумя группами. Семь видов бактерий, в основном
Fusobacterium,
Actinomyces и
Capnocytophaga, были доминирующими в группе здоровых пациентов, в то время как 51 вид, преимущественно
Streptococcus,
Veillonella и
Leptotrichia, преобладали в группе пациентов с АИГ. Примечательно, что были исследованы 23 функции генов, включая мембранный транспорт, углеводный метаболизм и метаболизм глицеролипидов, которые были доминирующими у пациентов с АИГ, и 31 функция генов, которые преобладали у здоровых лиц.
Далее была исследована корреляция между микробиомом полости рта и клиническими параметрами. С помощью алгоритма «случайного леса» (модель, состоящая из множества деревьев решений) были вычислены 5 оптимальных маркеров, и отличительный потенциал достиг 99,88% среди 46 с АИГ и 92 здоровых в когорте открытия и 100% – в когорте валидации. Важно отметить, что отличительный потенциал достиг 95,55% в межрегиональной когорте валидации. В заключение: это исследование является первым, где дается характеристика микробиома полости рта у пациентов с АИГ и сообщается об успешном создании диагностической модели и межрегиональной валидации микробных маркеров для пациентов с АИГ. Важно отметить, что биомаркеры, нацеленные на микробиоту полости рта, могут служить мощными и неинвазивными диагностическими инструментами АИГ.
doi.org
Перевод на русский язык научной статьи осуществлен в соответствии с условиями открытой лицензии Creative Commons Attributions (CC BY) (
Creative Commons — Attribution 4.0 International — CC BY 4.0)
