Метод определения
ПЦР с детекцией в режиме «реального времени».
Исследуемый материал
Соскоб эпителиальных клеток урогенитального тракта (вагинальный, цервикальный, уретральный)
Синонимы: Микробиоценоз, вагинальный дисбиоз.
DNA, Real-time PCR, RT-PCR, Femoflor-Screen, bacteriological markers of vaginal dysbiosis, vaginal microflora of women.
Краткое описание исследования «Скрининг микрофлоры урогенитального тракта. Фемофлор Скрин.»
Внимание! Стоимость исследования указана для одной локализации.
Анализ позволяет выявлять безусловно-патогенные микроорганизмы (простейшие, вирусы и бактерии), колонизирующие урогенитальный тракт, давать количественную оценку общей бактериальной массы и лактобактерий, а также основных анаэробных микроорганизмов, микоплазм и дрожжеподобных грибов методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме реального времени.
Выявляемые показатели
Комплексная оценка состояния микробиоценоза влагалища:
- КВМ (контроль взятия материала), общая бактериальная масса (ОБМ), микоплазмы (Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp.), дрожжеподобные грибы (Candida spp.)
- абсолютные значения;
- нормофлора (Lactobacillus spp.), облигатно-анаэробные микроорганизмы Gardnerella vaginalis/Prevotella bivia/Porphyromonas spp.
- относительные количества генетически родственных групп микроорганизмов в ОБМ;
- идентификация патогенов (Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Cytomegalovirus, Herpes simplex virus 1, Herpes simplex virus 2).
Под «spp.» подразумевается широкая группа микроорганизмов, значимая для диагностики дисбиоза.
Микробиоценоз влагалища женщин репродуктивного возраста – хорошо сбалансированная и устойчивая система. В норме в этом биотопе существуют микроорганизмы, способные выжить, сосуществовать и развиваться в конкретной физической среде, не вызывая заболевания макроорганизма. Доминирующими агентами в микробиоценозе являются лактобактерии, продуктом жизнедеятельности которых является α-оксипропионовая молочная кислота, которая создаёт кислую реакцию влагалищного содержимого. Кроме кислой среды размножению патогенных микроорганизмов препятствуют образующаяся в результате жизнедеятельности лактобацилл перекись водорода, лизоцим и другие гликолитические ферменты. Помимо лактобактерий, в урогенитальном тракте здоровой женщины репродуктивного возраста может обнаруживаться более ста видов различных бактериальных микроорганизмов, грибов, вирусов и простейших.
Специфика исследования и особенности, которые могут повлиять на результат теста «Скрининг микрофлоры урогенитального тракта. Фемофлор Скрин.»
Возникновение нарушений количественно-качественных взаимоотношений резидентных микроорганизмов – сапрофитных и условно-патогенных, населяющих мочеполовую систему в норме, приводит к возникновению дисбаланса. Развитие дисбаланса микробиоценоза может сопровождаться метаболическими, иммунными нарушениями и в ряде случаев клиническими проявлениями, степень выраженности которых варьируется от бессимптомного носительства до выраженной клинической манифестации. В связи с вышеизложенным, такие нозологии как бактериальный вагиноз, урогенитальный кандидоз, заболевания, ассоциированные с микоплазмой, могут рассматриваться как частные случаи проявления дисбаланса микробиоценоза. В настоящее время для установления диагноза используют традиционные методы клинической и лабораторной диагностики. Этиологически значимые инфекционные агенты выявляются с помощью методов лабораторного исследования: микроскопии нативных и окрашенных метиленовым синим и по Граму препаратов, культурального исследования (5% кровяной агар, среда Эндо, жидкие и твёрдые среды Сабуро), ПЦР-диагностики. Стандартные методы лабораторной диагностики урогенитальных инфекций имеют ряд объективных ограничений; качество выполнения исследований во многом определяется профессиональной квалификацией врача клинической лабораторной диагностики.
Микроскопия мазков, окрашенных по Граму, позволяет определить:
- количество и морфотинкториальные характеристики эпителиоцитов;
- количество лейкоцитов, наличие фагоцитоза;
- морфотипы микроорганизмов (10 морфотипов);
- относительную количественную характеристику общего числа микроорганизмов в исследуемом препарате.
Объективные ограничения светооптической микроскопии позволяют идентифицировать только 10 морфотипов: Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Bacteroides spp., Mobiluncus spp., Fusobacterium spp., Leptotrihia spp., Veillonella spp., Candida spp., грамположительные кокки, колиформные палочки, при этом многие виды этиологически значимых облигатных и условно-патогенных возбудителей выявить невозможно. Кроме того, микроскопия даёт приблизительную количественную оценку биоценоза, что особенно существенно в определении этиологического значения выявленных условно-патогенных микроорганизмов в развитии воспалительного процесса у конкретной пациентки.
Существенными недостатками также являются субъективизм и зависимость результата исследования от профессиональной квалификации врача клинической лабораторной диагностики.
Классическая микробиология до настоящего времени является «золотым стандартом» лабораторной диагностики, поскольку позволяет выполнить количественную характеристику, идентифицировать микроорганизм до вида и определить чувствительность выделенного штамма к лекарственным препаратам. Однако и этот метод не лишён ряда недостатков. Условно-патогенные микроорганизмы, главным образом, представлены анаэробными и факультативно-анаэробными микроорганизмами, для культивирования которых требуются высококачественные селективные питательные среды, специализированные лаборатории, оснащённые необходимым лабораторным оборудованием для выращивания анаэробов, специальная подготовка медицинского персонала лаборатории и высокий профессионализм исследователей. Неизбежно снижение эффективности метода в связи с объективными и субъективными погрешностями. Недостатком метода являются также длительные сроки культивирования (в среднем 7 дней) и необходимость сохранения жизнеспособности микроорганизмов до момента поступления биоматериала в лабораторию. Кроме того, ряд этиологически значимых микроорганизмов относятся к труднокультивируемым, что не позволяет основывать верификацию диагноза на результатах культурального исследования. Метод ПЦР с детекцией результата по окончании реакции без количественного определения инфекционного возбудителя позволяет быстро и эффективно выявить искомый патогенный или условно-патогенный микроорганизм, минуя стадию культивирования и выделения чистых культур. Однако выявление условно-патогенных микроорганизмов без учёта количества конкретного микроорганизма и количественно-качественного состава исследуемого биотопа в целом, не позволяет определить этиологическое значение выявленных условно-патогенных микроорганизмов в развитии инфекционно-воспалительного процесса у конкретного пациента. Решением проблемы количественной оценки широкого спектра условно-патогенных микроорганизмов является способ диагностики, основанный на использовании метода ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (RT-PCR). С его помощью стало возможным количественное обнаружение клинически значимых трудно- и некультивируемых условно-патогенных микроорганизмов – грамположительных бактерий (Atopobium vaginae), облигатно-анаэробных грамотрицательных бактерий (Prevotella spp, Veilonella spp, Porphyromonas spp, Fusobacterium spp, Eubacterium spp, Sneathia spp, Leptotrichia spp, Megasphaera spp, Dialister spp, Lachnobacterium spp).
В основу способа положена комплексная количественная оценка микробиоценоза урогенитального тракта путём сравнения содержания конкретных представителей нормо- и условно-патогенной биоты с общей бактериальной массой (ОБМ):
- сравнение количества лактобактерий с ОБМ даёт возможность оценить выраженность нарушений нормофлоры;
- соотношение количеств условных патогенов в ОБМ позволяет определять значимость тех или иных микроорганизмов в развитии дисбаланса и степень его выраженности;
- качество взятого соскоба и адекватность результата исследования оценивается с помощью специального параметра – контроля взятия материала (КВМ). КВМ представляет собой количество геномной ДНК человека в биоматериале, источником которой являются эпителиальные клетки, попадающие в пробу при правильной технике взятия биоматериала;
- результаты количественных исследований методом RT-PCR не только дают возможность врачу определять объём необходимого вмешательства, но и позволяют выбрать точную направленность терапии;
- впервые можно оценить эффективность лечения и то, насколько удалось восстановить нормальный баланс биоценоза. В ходе исследования за короткий промежуток времени из одной биопробы выполняется количественная оценка КВМ, ОБМ (степень обсемененности), нормофлоры, безусловных патогенов и условно-патогенных микроорганизмов.
Аналитические показатели
Аналитическая чувствительность исследования для всех, кроме Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Cytomegalovirus, Herpes simplex virus 1, Herpes simplex virus 2-10000 копий ДНК/мл). Для Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Cytomegalovirus, Herpes simplex virus 1, Herpes simplex virus 2-2000 копий ДНК/мл).
С какой целью проводят исследование «Скрининг микрофлоры урогенитального тракта. Фемофлор Скрин.»
Анализ позволяет выявлять безусловно-патогенные микроорганизмы, колонизирующие урогенитальный тракт, а также основных анаэробных микроорганизмов, микоплазм и дрожжеподобных грибков. Исследование предназначено для комплексной оценки состояния урогенитального тракта, может быть рекомендовано для проведения скрининга, клинического обследования и мониторинга эффективности проведенного лечения.