Исследование биоценоза урогенитального тракта. Фемофлор 8.

Комплексная количественная оценка микробиоценоза урогенитального тракта путём сравнения содержания конкретных представителей нормо- и условно-патогенной биоты с общей бактериальной массой (ОБМ) методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме «реального времени».

Выявляемые показатели:

• КВМ (контроль взятия материала), ОБМ (общая бактериальная масса), микоплазмы (Mycoplasma hominis), дрожжеподобные грибы (Candida spp.) – абсолютные значения; 
• нормофлора (Lactobacillus spp.), факультативно-анаэробные (Enterobacterium spp., Streptococcus spp.,), облигатно-анаэробные микроорганизмы (Gardnerella vaginalis/Prevotella bivia/Porphyromonas spp., Eubacterium spp.) – относительные количества генетически родственных групп микроорганизмов в ОБМ;
• идентификация патогенов (Mycoplasma genitalium). 

Под «spp.» подразумевается широкая группа микроорганизмов, значимая для диагностики дисбиоза.

Микробиоценоз влагалища женщин репродуктивного возраста - хорошо сбалансированная и устойчивая система. В норме в этом биотопе существуют микроорганизмы, способные выжить, сосуществовать и развиваться в конкретной физической среде, не вызывая заболевания макроорганизма. Доминирующими агентами в микробиоценозе являются лактобактерии, продуктом жизнедеятельности которых является a-оксипропионовая молочная кислота, которая создаёт кислую реакцию влагалищного содержимого. Кроме кислой среды размножению патогенных микроорганизмов препятствуют образующаяся в результате жизнедеятельности лактобацилл перекись водорода, лизоцим и другие гликолитические ферменты. Помимо лактобактерий, в урогенитальном тракте здоровой женщины репродуктивного возраста может обнаруживаться более ста видов различных бактериальных микроорганизмов, грибов, вирусов и простейших. Возникновение нарушений количественно-качественных взаимоотношений резидентных микроорганизмов - сапрофитных и условно-патогенных, населяющих мочеполовую систему в норме, приводит к возникновению дисбаланса. Развитие дисбаланса микробиоценоза может сопровождаться метаболическими, иммунными нарушениями и в ряде случаев клиническими проявлениями, степень выраженности которых варьируется от бессимптомного носительства до выраженной клинической манифестации. В связи с вышеизложенным, такие нозологии как бактериальный вагиноз, урогенитальный кандидоз, заболевания, ассоциированные с микоплазмой, могут рассматриваться как частные случаи проявления дисбаланса микробиоценоза. В настоящее время для установления диагноза используют традиционные методы клинической и лабораторной диагностики. Этиологически значимые инфекционные агенты выявляются с помощью методов лабораторного исследования: микроскопии нативных и окрашенных метиленовым синим и по Граму препаратов, культурального исследования (5% кровяной агар, среда Эндо, жидкие и твёрдые среды Сабуро), ПЦР-диагностики. Стандартные методы лабораторной диагностики урогенитальных инфекций имеют ряд объективных ограничений; качество выполнения исследований во многом определяется профессиональной квалификацией врача клинической лабораторной диагностики. Микроскопия мазков, окрашенных по Граму, позволяет определить:

1. количество и морфотинкториальные характеристики эпителиоцитов;
2. количество лейкоцитов, наличие фагоцитоза;
3. морфотипы микроорганизмов (10 морфотипов);
4. относительную количественную характеристику общего числа микроорганизмов в исследуемом препарате.

Объективные ограничения светооптической микроскопии позволяют идентифицировать только 10 морфотипов: Lactobacillus spp., Gardnerella vaginalis, Bacteroides spp., Mobiluncus spp., Fusobacterium spp., Leptotrihia spp., Veillonella spp., Candida spp., грамположительные кокки, колиформные палочки, при этом многие виды этиологически значимых облигатных и условно-патогенных возбудителей выявить невозможно. Кроме того, микроскопия даёт приблизительную количественную оценку биоценоза, что особенно существенно в определении этиологического значения выявленных условно-патогенных микроорганизмов в развитии воспалительного процесса у конкретной пациентки. Существенными недостатками также являются субъективизм и зависимость результата исследования от профессиональной квалификации врача клинической лабораторной диагностики. Классическая микробиология до настоящего времени является «золотым стандартом» лабораторной диагностики, поскольку позволяет выполнить количественную характеристику, идентифицировать микроорганизм до вида и определить чувствительность выделенного штамма к лекарственным препаратам. Однако и этот метод не лишен ряда недостатков. Условно-патогенные микроорганизмы, главным образом, представлены анаэробными и факультативно-анаэробными микроорганизмами, для культивирования которых требуются высококачественные селективные питательные среды, специализированные лаборатории, оснащённые необходимым лабораторным оборудованием для выращивания анаэробов, специальная подготовка медицинского персонала лаборатории и высокий профессионализм исследователей. Неизбежно снижение эффективности метода в связи с объективными и субъективными погрешностями. Недостатком метода являются также длительные сроки культивирования (в среднем 7 дней) и необходимость сохранения жизнеспособности микроорганизмов до момента поступления биоматериала в лабораторию. Кроме того, ряд этиологически значимых микроорганизмов относятся к труднокультивируемым, что не позволяет основывать верификацию диагноза на результатах культурального исследования. Метод ПЦР с детекцией результата по окончании реакции без количественного определения инфекционного возбудителя позволяет быстро и эффективно выявить искомый патогенный или условно-патогенный микроорганизм, минуя стадию культивирования и выделения чистых культур. Однако выявление условно-патогенных микроорганизмов без учёта количества конкретного микроорганизма и количественно-качественного состава исследуемого биотопа в целом, не позволяет определить этиологическое значение выявленных условно-патогенных микроорганизмов в развитии инфекционно-воспалительного процесса у конкретного пациента. Решением проблемы количественной оценки широкого спектра условно-патогенных микроорганизмов является способ диагностики, основанный на использовании метода ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (RT-PCR). С его помощью стало возможным количественное обнаружение клинически значимых трудно- и некультивируемых условно-патогенных микроорганизмов - грамположительных бактерий (Atopobium vaginae), облигатно-анаэробных грамотрицательных бактерий (Prevotella spp, Veilonella spp, Porphyromonas spp, Fusobacterium spp, Eubacterium spp, Sneathia spp, Leptotrichia spp, Megasphaera spp, Dialister spp, Lachnobacterium spp). ‏ В основу способа положена комплексная количественная оценка микробиоценоза урогенитального тракта путём сравнения содержания конкретных представителей нормо– и условно-патогенной биоты с общей бактериальной массой (ОБМ):

• сравнение количества лактобактерий с ОБМ даёт возможность оценить выраженность нарушений нормофлоры;
• соотношение количеств условных патогенов в ОБМ позволяет определять значимость тех или иных микроорганизмов в развитии дисбаланса и степень его выраженности;
• качество взятия соскоба и адекватность результата исследования оценивается с помощью специального параметра – контроля взятия материала (КВМ). КВМ представляет собой количество геномной ДНК человека в биоматериале, источником которой являются эпителиальные клетки, попадающие в пробу при правильной технике взятия биоматериала;
• результаты количественных исследований методом RT-PCR не только дают возможность врачу определять объём необходимого вмешательства, но и позволяют выбрать точную направленность терапии;
• впервые можно оценить эффективность лечения и то, насколько удалось восстановить нормальный баланс биоценоза.

В ходе исследования за короткий промежуток времени из одной биопробы выполняется количественная оценка КВМ, ОБМ (степень обсеменённости), нормофлоры, факультативно-анаэробных и облигатно-анаэробных микроорганизмов, дрожжеподобных грибов, патогенов. Материал для исследований. Для исследования женщин в репродуктивном возрасте используют соскобы эпителиальных клеток из влагалища (заднебоковые своды). Соскобы из уретры и цервикального канала могут быть исследованы по решению врача; в этих случаях трактовка результатов отличается. Аналитические показатели: Аналитическая чувствительность исследования для всех, кроме Mycoplasma genitalium -10000 копий ДНК/мл. Для Mycoplasma genitalium – 2000 копий/мл. Обратите внимание на учебное пособие для врачей! Урогенитальные инфекции, обусловленные условно-патогенной биотой, у женщин репродуктивного возраста. * КВМ - Контроль взятия материала

Цветовое обозначение групп микроорганизмов на диаграмме:

•  
  общая бактериальная масса
•  
  нормофлора (Lactobacillus spp.)
•  
  факультативно-анаэробные микроорганизмы
•  
  облигатно-анаэробные микроорганизмы
•  
  микоплазмы
•  
  дрожжеподобные грибы

Обратите внимание на учебное пособие для врачей! Урогенитальные инфекции, обусловленные условно-патогенной биотой, у женщин.