Определение возбудителей острых респираторных вирусных инфекций человека (ОРВИ) в соскобе эпителиальных клеток ротоглотки и носоглотки (Determination of pathogens of acute respiratory viral infections (ARVI) in scrapes of epithelial cells of oropharynx an

Синонимы: Анализ соскоба слизистой носо- и ротоглотки на частые возбудители ОРВИ – аденовирус групп В, С, Е, бокавирус, метапневмовирус, респираторно-синцитиальный вирус, риновирус, вирус парагриппа 1, 2, 3, 4 типов, коронавирус NL-63, 229E, ОС43, НСU1.

Nasopharyngeal and oropharyngeal swabs testing for frequent ARTIs viral pathogens – adenovirus of B, C E groups, bocavirus, metapneumovirus, respiratory syncytial virus, adenovirus, parainfluenza viruses of types 1, 2, 3, 4, coronaviruses NL-63, 229E, ОС43, НСU1.

Краткое описание исследования «Определение возбудителей острых респираторных вирусных инфекций человека (ОРВИ) в соскобе эпителиальных клеток ротоглотки и носоглотки»

Острую респираторную вирусную инфекцию (ОРВИ), помимо вируса гриппа, чаще вызывают представители трех семейств РНК-содержащих вирусов:

• парамиксовирусы (респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус человека, вирусы парагриппа 1-4);
• коронавирусы и пикорнавирусы (риновирусы);

и двух семейств ДНК-содержащих вирусов:

• аденовирусы (виды B, C, E);
• парвовирусы (бокавирус человека).

Респираторно-синцитиальный вирус (РС-вирус, Respiratory syncytial virus, RSV) является основным возбудителем бронхиолитов и пневмоний у младенцев и детей младшего возраста во всем мире. В группу риска тяжелого течения PC-вирусной инфекции входят:

• недоношенные младенцы;
• дети до двух лет;
• дети и взрослые с ослабленной вследствие заболеваний или лечения иммунной системой;
• пожилые люди (старше 65 лет).

Метапневмовирус (Human metapneumovirus, HMPV) – это РНК-содержащий вирус семейства парамиксовирусов. Наиболее частыми симптомами метапневмовирусной инфекции являются:

• кашель;
• насморк;
• одышка;
• лихорадка;
• общее недомогание, головная боль.

Метапневмовирус занимает второе после РС-вируса место в этиологии острого бронхиолита у детей первого года жизни.

Частые осложнения метапневмовирусной инфекции отмечаются со стороны ЛОР-органов.

Основными заболеваниями, развивающимися при инфицировании метапневмовирусами у детей, являются:

• бронхиолиты;
• пневмония;
• бронхиальная астма.

Вирусы парагриппа (Parainfluenza virus, PIV) часто обнаруживаются у детей младшего возраста. Ко второму году жизни каждый ребенок хотя бы один раз переболевает ОРВИ, вызванной вирусами парагриппа. Вирусы парагриппа 2-го и 4-го типов чаще обнаруживают у детей первого года жизни, по сравнению с другими возрастными группами, где превалируют вирусы парагриппа 1-го и 3-го типов.

Аденовирусы (Adenovirus), подразделяют на семь видов: A, B, C, D, E, F, G. Аденовирусная инфекция вызывает острые заболевания, протекающие с умеренно выраженным интоксикационным синдромом и симптоматикой, зависящей от вида вируса с поражением:

• слизистых оболочек верхних дыхательных путей;
• лимфоидной ткани;
• глаз;
• кишечника.

Известны случаи бессимптомного носительства аденовирусов, служащих источником возбудителя, в лимфоидной ткани верхних дыхательных путей на протяжении нескольких месяцев и лет.

Коронавирусы (Coronaviruses, CoV). У человека острую респираторную инфекцию вызывают четыре вида распространенных в популяции коронавирусов (коронавирусная инфекция SARS-CoV-2 рассматривается отдельно, см. тест № 3320):

• 229E;
• OC43;
• NL63;
• HKUI

Заболевание чаще протекает с поражением верхних дыхательных путей легкой или средней степени тяжести, в редких случаях – с поражением нижних дыхательных путей. Кишечная разновидность инфекции встречается гораздо реже, в основном у детей. ОРВИ, вызванная коронавирусами, обычно длится в течение нескольких дней и заканчивается полным выздоровлением. Однако в ряде случаев заболевание может протекать в форме атипичной пневмонии или тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС). Эта патология характеризуется высокой летальностью, поскольку сопровождается острой дыхательной недостаточностью.

Самым распространенным возбудителем ОРВИ среди взрослого населения и детей всех возрастных групп являются риновирусы (Rhinovirus, RV), вызывающие воспаление слизистой оболочки верхних дыхательных путей. Инфекция проявляется насморком и кашлем, нередко осложняется трахеитом.

В 2005 г. был описан бокавирус (Bocavirus, BV) человека. Бокавирус обычно обнаруживается у младенцев и детей, нередко в сочетании с другими возбудителями ОРВИ. Бокавирусная инфекция проявляется:

• лихорадкой;
• кашлем;
• насморком;
• диареей.

У взрослых при тесном контакте с больными детьми бокавирус может вызывать легкие симптомы острого респираторного заболевания (ОРЗ), в редких случаях вирус обнаруживается при пневмонии, возникшей на фоне иммунодефицита.

Метод ПЦР обладает большей диагностической чувствительностью и специфичностью, по сравнению с другими методами выявления возбудителей ОРВИ (например, с иммунохроматографией и иммунофлуоресценцией).

Аналитические показатели

Аналитическая чувствительность

Бокавирус, метапневмовирус, респираторно-синцитиальный вирус, риновирус, вирус парагриппа 1, вирус парагриппа 2, вирус парагриппа 3, вирус парагриппа 4, коронавирус NL-63, коронавирус 229E, коронавирус ОС43, коронавирус НСU1 –×10^3 копий/мл исходного образца.

Аналитическая специфичность

Перекрестных реакций с вирусами гриппа А и В, аденовирусами, коронавирусом SARS-CoV-2 и микроорганизмами Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Prevotella spp., Leptotrichia spp., Corynebacterium spp., Neisseria spp. не обнаружено.

С какой целью выполняют исследование

Тест используется для дифференцировки вирусных и бактериальных инфекций дыхательных путей при выраженных симптомах заболевания.

Что может повлиять на результат исследования

Нарушение правил подготовки может повлиять на результат.

Литература

1. Ветрова Е. Н. и др. Мониторинг респираторных вирусных инфекций в 2011-2022 годах в Москве //Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2023. – Т. 100. – №. 5. – С. 328-337.
2. Клинические рекомендации. Вирусные пневмонии. – 2024.
3. Клинические рекомендации. Острая респираторная вирусная инфекция (ОРВИ). Дети. – 2022.
4. Клинические рекомендации. Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) у взрослых. – 2021.
5. Клинические рекомендации. Острый тонзиллит и фарингит (Острый тонзиллофарингит). – 2021.
6. Кокорева С. П., Разуваев О. А., Разуваева Ю. Ю. Особенности метапневмовирусной инфекции у детей //Академическая публицистика. – 2021. – №. 4. – С. 626-632.
7. Львов Д. К. и др. Особенности циркуляции вирусов гриппа и ОРВИ в эпидемическом сезоне 2019-2020 гг. в отдельных регионах России //Вопросы вирусологии. – 2020. – Т. 65. – №. 6. – С. 335-349.
8. Мамошина М. В., Яцышина С. Б., Акимкин В. Г. Анализ результатов мониторинга возбудителей ОРВИ, гриппа и COVID-19 у бессимптомных лиц //Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2023. – Т. 2. – С. 63-9.
9. Цыганков А. Е. и др. Особенности течения тяжелого острого бронхиолита метапневмовирусной этиологии у детей //Детские инфекции. – 2024. – Т. 23. – №. 3. – С. 18-21.
10. Шарипова Е. В., Бабаченко И. В., Орлова Е. Д. Метапневмовирусная инфекция у детей //Педиатр. – 2020. – Т. 11. – №. 5. – С. 13-19.

Правила подготовки к исследованию

Взятие биологического материала желательно проводить до диагностических и лечебных манипуляций в предполагаемом месте локализации возбудителя.

Взятие биологического материала рекомендуется проводить до начала применения лекарственных препаратов (антибактериальных, противовирусных, противопаразитарных). При проведении исследований в целях контроля лечения целесообразно проводить взятие проб на ПЦР-исследование не ранее, чем через 10-14 дней после окончания применения соответствующих препаратов локального действия и не ранее, чем через один месяц после проведения системной терапии.

При подготовке пациента к процедуре следует учесть:

• за 6 часов до исследования не рекомендуется использовать лекарственные средства для орошения ротоглотки и препараты для рассасывания;
• непосредственно перед взятием биологического материала не рекомендуется использовать жевательную резинку/пастилки для освежения дыхания;
• непосредственно перед взятием биоматериала прополоскать полость рта питьевой водой комнатной температуры;
• если полость носа заполнена слизью, перед процедурой взятия биоматериала рекомендуется провести высмаркивание.

Желательно соблюдать все описанные условия, если лечащим врачом не рекомендовано иное.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: тест качественный.

Форма представления результата

Результат выдается в терминах «обнаружено» или «не обнаружено».

Трактовка результатов исследования «Определение возбудителей острых респираторных вирусных инфекций человека (ОРВИ) в соскобе эпителиальных клеток ротоглотки и носоглотки»

Обнаружено

В анализируемом образце биологического материала найден фрагмент ДНК/РНК, специфичный для возбудителя ОРВИ.

Не обнаружено

В анализируемом образце биологического материала не обнаружен фрагмент ДНК/РНК, специфичный для возбудителя ОРВИ, или концентрация ДНК/РНК возбудителя в образце ниже границы чувствительности метода.